故事敘述在美國南北戰(zhàn)爭時(shí)期，有五個(gè)被困在南軍中的北方人，其中一個(gè)還是個(gè)孩子，趁著一個(gè)機(jī)會(huì)用氣球逃脫了。他們中途被風(fēng)暴吹落在太平洋中的一個(gè)荒島上，但是他們并沒有絕望，而是團(tuán)結(jié)互助，運(yùn)用大家的智慧和辛勤勞動(dòng)，從赤手空拳一直到制造出陶器、玻璃、風(fēng)磨、電報(bào)機(jī)等等，從而建立起富裕幸福的生活。
他們在一次意外中馴化了一只黑猩猩于普(Jup，又譯杰普、朱普)，還挽救了在附近另一孤島獨(dú)居了十二年而失去理智的罪犯艾爾通(故事見《格蘭特船長的兒女》)，使他恢復(fù)了人性，成為他們的忠實(shí)的伙伴。
有一次，一群海盜來到了這個(gè)島，并發(fā)現(xiàn)了他們的存在，最后他們憑借智慧與神秘人的.幫助打敗了海盜。
這幾個(gè)遇難者在荒島上度過的歲月里，每當(dāng)危難時(shí)刻，總有一個(gè)神秘人物在援助他們，這個(gè)人就是在他們到達(dá)之前就已住在島上一個(gè)巖洞里的尼摩船長(《海底兩萬里》一書中的主人公、潛水船鸚鵡螺號(hào)的建造者)。
這些荒島上的遇難者雖然什么也不缺，但是他們并沒有放棄返回祖國的努力。最后，在一次火山爆發(fā)中，這幾個(gè)人都險(xiǎn)些喪命，直到格蘭特船長的兒子羅伯特所指揮的“鄧肯號(hào)”經(jīng)過那里，才將他們搭救。
回到美國之后，這幾個(gè)“島民”又重新開始他們在島上建立的事業(yè)。